Makoto Naegi, un adolescente sin talento notable, se sorprende al enterarse de que ha sido aceptado en la Academia Privada Hope's Peak: una escuela de élite que reúne a los mejores estudiantes de diversos campos. A pesar de creer que su admisión fue solo un golpe de suerte, Naegi está encantado de asistir a una institución conocida por garantizar el éxito a quienes se graduan. Decidido, entra por las puertas de la prestigiosa academia.